Introducción al análisis de datos ómicos

Cuándo: 10 y 11 de octubre de 2022, de 9 a 12:30 am

Dónde: Aula Francisco Grande HU-FJD

Tipo: Presencial

Imparte: Unidad de Bioinformática IIS-FJD

Material del Curso

Módulo 1: Análisis Genómico. Bases de datos, protocolos (pipelines) detección de variantes y análisis.

Raquel Romero

Plataforma de filtrado y priorización de variantes: Franklin

Vamos a tener un entorno común para trabajar en Franklin con datos chiméricos ya subidos: Recibirás una invitación de la web franklin (https://franklin.genoox.com/) para formar parte del grupo de trabajo IIS-FJD, para poder ver el material compartido. Acepta la invitación y regístrate.

Visualizador de secuencias: IGV

Módulo 2: Análisis Transcriptómico. Aplicaciones, pasos de una pipeline de cuantificación de expresión, análisis exploratorio de las muestras, normalizaciones y expresión diferencial.

Gonzalo Núñez Moreno

Plataforma de análisis de RNASeq: Galaxy

Hazte un usuario en Galaxy antes de comenzar las prácticas: Register

Módulo 3: Análisis e interpretación funcional de experimentos ómicos. Bases de datos, programas de enriquecimiento funcional y de análisis de redes biológicas.

Pablo Mínguez

Algo de ruido de fondo ..